以食源性疾病监测与溯源服务于食品安全风险预警为目标，全面提升食源性疾病主动监测、溯源调查、归因分析、负担研究、耐药监测等科研能力，重点研究聚集性病例识别技术、食源性疾病及单病种负担评估、基于全基因序列分析的溯源技术和食源性致病菌耐药株在动物、环境、食品、人群间的传播机制等。加强食源性疾病监测综合人才和科学交叉型人才的培养，培养1名学科带头人和2-3名学术骨干，形成包括微生物和化学检验、生物信息分析、流行病与卫生统计、食品安全风险评估等专业人才组成的核心团队，全面提升食源性疾病监测、溯源和预警能力，力争在一下四个方面取得突破：（1）掌握我国食源性疾病负担；（2）建立实验室质量控制体系，致病菌的分离预期值达到国际水平；（3）强化现场流行病学、实验室检测、分析分型等技术培训，实现食源性疾病综合食物链追踪溯源；（4）完成食源性致病菌耐药检测技术、数据分析的标准化建设，编制统一的操作标准程序，建立耐药监测数据库。
